疯狂动物园中隐藏动物的种类约为20种，分布在草原、丛林、山脉、澳洲等不同地图区域。这些特殊动物需要玩家达成特定条件才会出现，例如骑乘特定距离、连续换乘不同动物或完成特殊互动。隐藏动物的设计增加了游戏探索深度，也为玩家提供了更具挑战性的收集目标。
从触发机制来看，隐藏动物主要分为距离触发型、换乘型和互动型三类。距离触发型如暗黑野牛需要骑乘同一只野牛行进700-800米，而鸭嘴河马要求河马持续骑行1600米；换乘型包括特洛伊斑马需连续切换7种草原动物，纯黑鹿需换乘8种不同动物；互动型则像蒸汽朋克需用牦牛撞击10只动物，机械秃鹰需借助大象狂暴将其甩至高处。这些机制设计考验玩家的操作技巧和耐心。
部分隐藏动物存在时间或环境限定条件。雄鸡鳄在上午出现概率较高，罗宾汉鹰需要沿跑道边缘灌木丛方向飞出才能发现，仙女企鹅则要求换乘组合中包含7种极地动物和1种外来动物。这类设定增强了游戏的随机性和探索乐趣，玩家需要观察环境特征并把握时机。
从游戏设计角度分析，隐藏动物系统通过分层难度设置延长了游戏生命周期。基础隐藏动物如暗黑野牛可通过单一操作解锁，而三嘴鸟需要巨嘴鸟起跳100米并安全换乘，苏-24战斗熊需老鹰飞行2000米，这些高阶目标形成了循序渐进的挑战阶梯。该设计既照顾休闲玩家体验，也为硬核玩家提供钻研空间。
玩家需注意隐藏动物的抓捕具有不可逆性，成功驯服后即可永久获得。部分动物如油炸狮允许中途复活累计进度，而机械秃鹰等则需一次性完成条件。建议优先完成允许进度累计的目标，再挑战高难度一次性任务，这种策略能有效提升收集效率。
